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前言

台灣近年來國際交流、旅遊頻繁及引進外勞等均使境外移入傳染病機會大幅增加，面對未來新興疫病之威脅，加上本土性傳染病亦蠢蠢欲動，當前我國防疫政策、檢疫、疫情監視及檢驗研究能力，已不敷疫病管制需求。在高科技、國際化發展的大遠景之下，防疫工作必須具有整體性、迅速性、有效性及國際性之功能。因此，建立現代化防疫體系，維護國人健康，為各界期望本局成立之宗旨。
業務職掌
1.防疫制度之規劃及法規之研擬事項。
2.各種疫病之預防、控制、調查及研究事項。
3.疫病爆發之應變處理事項。
4.國內疫情之通報及疫情監視事項。
5.國際疫情之蒐集、交換及報告事項。
6.防疫藥物之採購及管理事項。
7.預防接種之規程、推動及受害救濟事項。
8.疫苗及生物製劑之製造、供應、研發及技術轉移事項。
9.各種疫病之檢驗事項。
10.疫病檢驗標準之訂定及檢驗認証事項。
11.營業衛生之規劃、推動及督導事項。
12.國際港埠之檢疫及衛生管理事項。
13.外籍勞工之衛生管理事項。
14.地方衛生機關執行本局主管事務之指揮及督導事項。
15.疫病管制事務之國際合作及交流事項。
16.疫病管制專業人員之培訓事項。
17.其他有關防疫、預防醫學之研究與發展、檢疫及經行政院衛生署指定之疾病管制事項。
成果
1.1948 年根除鼠疫。
2.1948 年起實施各項預防接種 (1948 年白喉類毒素、 1955 年白喉、百日咳、破傷風混合疫苗、 1965 年卡介苗、 1966 年口服小兒麻痺疫苗、 1968 年日本腦炎疫苗、 1978 年麻疹疫苗、 1984 年 B 型肝炎疫苗、 1986 年德國麻疹疫苗、 1992 年麻疹、腮腺炎、德國麻疹混合疫苗 ) ，降低各項傳染病之發生率。
3.1955 年根除天花。
4.1959 年根除狂犬病。
5.1965 年根除瘧疾。
6.1984 年開始推動 B 型肝炎預防注射，降低 84% 兒童帶原率。
7.1995 年開始推動 A 型肝炎預防注射，山地鄉不再爆發流行。
8.1998 年開始推動老人流感疫苗注射，降低 54% 住院率。
9.1999 年完成根除小兒麻痺相關證明文件

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