疾病管制局6月13日公布本（2011）年首例日本腦炎確定病例，該名病例為63歲女性，居住於高雄市湖內區，個案於6月4日開始發病，出現頭痛、意識障礙及頸部僵硬等症狀，並於6月7日前往醫院就醫且被通報，6月10日經該局檢驗確定，目前該個案語言表達、反應能力不佳，但肢體可活動且持續住院治療中。該個案近三個月無出國史，衛生單位持續進行追蹤。
依據疾管局歷年監測資料顯示，臺灣日本腦炎病例集中於5月至10月發生，高峰期通常出現在6月至7月。感染日本腦炎的潛伏期通常為5至15天，嚴重者可能導致精神、神經性後遺症或死亡。日本腦炎的病媒蚊以三斑家蚊為主，吸血高峰期為黃昏與黎明時分，而豬隻為日本腦炎病毒主要的增幅動物。
疫苗接種為預防日本腦炎最有效的方法，每年集中接種時間為3月至5月，可延長至9月；年滿15個月的幼兒，應接受2劑注射，其間相隔2週，隔年接種第3劑，小學一年級時再追加接種一劑。請父母親儘速帶領尚未完成日本腦炎疫苗接種之適齡幼兒前往衛生所或指定醫療機構完成接種；而工作或生活中有感染之虞的成人，可前往全國22家署立醫院或分院、臺大醫院雲林分院或國立陽明大學附設醫院自費接種(約250-500元)。
疾病管制局呼籲目前已進入日本腦炎流行季節，且正值夏季及病媒蚊最易孳生之際，應儘量避免於病媒蚊活動的高峰期，在豬舍、其他動物畜舍或病媒蚊孳生地點的附近活動；若無法避免，請穿著淺色長袖衣褲，並於身體裸露處塗抹衛生署核可之防蚊藥劑，做好防蚊措施以防蚊蟲叮咬，降低感染風險。有關日本腦炎最新疫情及各項資訊，可撥打民眾疫情通報及諮詢專線：1922或參閱疾管局全球資訊網http://www.cdc.gov.tw。