台北縣烏來鄉於八月底及九月初陸續接獲五名桿菌性痢疾疑似病例，這幾名病例並經疾病管制局檢驗室確認為桿菌性痢疾陽性個案。經當地衛生局及疾病管制局調查發現，這些個案主要仍是人和人的接觸造成的散發性感染病例，另經衛生局主動疫情調查發現其他十九例無臨床明顯症狀之病例。自九月十四日後，衛生單位並未再接獲由醫師通報的個案。

疾病管制局及台北縣衛生局為控制疫情，已於九月初採取相關防疫措施，除勸導陽性個案住院接受隔離治療外，並擴大進行個案家屬、接觸者採檢及預防性投藥工作，提供消毒水及漂白粉給家戶，進行環境及水塔消毒、並逐戶提供衛教單張對民眾實施衛生教育宣導，此外也雇工進行環境消毒，以除去所有可能之感染源。

疾病管制局再度呼籲，桿菌性痢疾是一種經由糞口傳染的腸道細菌性傳染病，主要的傳染途徑可能為（1）直接或間接吃入被病人或帶菌者糞便污染的東西。（2）帶菌者或患者上完廁所後未洗手或未洗乾淨而和人握手，接觸者未洗手而拿食用東西。（3）喝入受患者或帶菌者糞便污染且未經煮沸的水。疾病的潛伏期為12-96小時（通常1-3天），感染後常見的症狀有：腹瀉、伴隨發燒、噁心，或有毒血症、嘔吐、痙攣及裏急後重。為預防桿菌性痢疾感染，特別是山地鄉的民眾，必須注意下列幾點：（1）不食用未經煮熟的食物或煮沸的水（2）進食前及上完廁所後最好以肥皂徹底洗手，勿用手抓東西吃（3）食物如未吃完應放入冰箱或加蓋保存，以免受蒼蠅等病媒污染（4）注意居家環境衛生，尤其家中最好使用有蓋垃圾桶，以免蒼蠅等病媒散播病菌。（5）排泄物妥善處理，不可隨地排放，以免污染水源。（6）如發生腹瀉等疑似症狀應儘速就醫及注意個人衛生，並避免照顧幼兒及處理食物以免散播病菌。

此次納莉颱風過後，災區雖未傳出桿菌性痢疾疫情，但部分地區因停電、淹水後環境衛生較差，居民在重建家園的同時，更應比平常更注意個人及飲食、飲水衛生，飯前便後務必洗手，飲水食物煮沸及熟食，並配合衛生單位指導，進行家戶環境消毒工作，以免感染腸道傳染病。