「96年度全國防疫會議」於4月19、20日假嘉義縣召開，以「落實公權力回顧、推動疫苗新政策」為主軸，透過中央與地方經驗交流，檢視防疫成果及展望未來。
在去（95）年的全國防疫會議中，疾病管制局郭旭崧局長明白揭示落實公權力之決心，強調防疫工作依法行政之重要性。在全國防疫工作伙伴積極配合下，這一年來成果豐碩，如為因應南部登革熱疫情，成立之「登革熱中央流行疫情指揮中心」，有效整合防疫資源，使疫情在短短三週後，便呈現下降控制趨勢。故本次會議特別請二十五個縣市衛生局針對去年最得意之防疫作為，由每一縣市進行五分鐘的經驗分享，希冀有助於爾後降低執行防疫公權力發生衝突之風險，兼顧防疫執法同仁之權益及防疫工作之落實。
另鑑於世界衛生組織認為疫苗接種是傳染病防治最直接及有效的方法，且各國亦不斷投注更多的資源在疫苗研發，包括多合一疫苗、新型疫苗等。故在本次會議中，將研析我國疫苗新政策，包括擴大流感疫苗接種計畫實施對象、我國人用疫苗研發等項目，期能提供民眾健康更全面性的保障。
本次會議包括衛生署、縣市衛生局、國防部、法務部、教育部及農委會等相關單位計約200餘人參加。期待透過中央跨部會及地方防疫人員經驗分享與工作交流，凝聚共識，共同為各項防疫工作努力打拼，強化人民對防疫安全之信心，保障全體人民的健康。