根據世界衛生組織及美國疾病管制中心自2005-2007年陸續出版的新興感染症雜誌(Emerging Infectious Diseases)發表的數十篇研究報告指出，近年來世界各國陸續發生超強抗藥性的金黃色葡萄球菌、鮑氏不動桿菌及肺結核等感染症，加上抗生素濫用導致困難腸梭菌腹瀉的事件報告，及區域性社區感染的抗藥性增加現象。使得正確使用抗生素及改善抗生素濫用問題，成為各國努力之重要感染症防治議題。
台灣國家衛生研究院長期研究，發現部分醫院常見的細菌抗藥性已出現下降的趨勢；而社區和醫院以外的收治機構細菌感染的抗藥性卻有上升的趨勢。
由於國人習慣將消炎止痛藥物與抗生素統稱為「消炎藥」，就醫時只要有疑似感染症狀，經常主動要求醫師開立含有消炎藥的處方，甚至於自行購買、儲備使用「消炎藥」，症狀略為改善就自行停藥或是換藥，這些不正確的用藥習慣，容易促使細菌發生突變，並與未具抗藥性的細菌混合，使得原本有效的抗生素無法有效殺死該細菌。
為因應細菌抗藥性問題，政府已於90年2月1日起增訂：「上呼吸道感染病患」，如屬一般感冒或病毒性感染者不應使用抗生素，限制醫師對抗生素之開立處方；而民眾則需注意下列事情：1.不隨便自行購買抗生素服用2.抗生素應遵照醫師指示使用，病人應完成整個療程的治療3.定時服藥，不隨意改變抗生素服藥的時間，抗生素的使用依照醫師指示使用，不能依據自己的經驗自行購買使用。