世界衛生組織近一、二年，由於歐、亞、美洲禽流感疫情頻傳，不斷提出病毒可能因持續傳播，發生突變，進而引起全球性流感大流行之警訊，並提醒各國應致力於防範工作；復以我國鄰近國家紛紛傳出動物或人類之相關疫情，故衛生署疾病管制局於今年八月中旬完成「我國因應流感大流行準備計畫」，政由行政院審核中，該計畫分有「物資儲備」及「防治動員」分支計畫，期望預先儲備流感抗病毒藥劑、防護裝備及新型流行性感冒疫苗之採購與自製，以避免一旦爆發流行，物資儲備不及，如此勢將影響我國民眾之健康保障。目前流感疫苗自製政策已獲確認，其他部分刻正就審核意見進行修訂中。
另為了準備及因應工作順利進行，該局另就疫情監視、邊境檢疫、醫療、實驗診斷、物資使用及風險溝通等重點進行流程及細節之規劃，起草完成「流感大流行防治作戰動員及準備計畫」第一版，基於過去SARS疫情的經驗，該局預計下週與各部會就需跨部會配合之事項進行第一次溝通協調，期能再疫情來襲之前，預先作好各項動員之準備工作。
該局亦已預定於十二月中旬依傳染病防治法將「新型流行性感冒」公告為法定傳染病，以完備疫情防治之法源依據，目前正進行全國約五百家之「新型流行性感冒採檢醫療機構」之徵求、簽約與訓練作業，民眾以後如出現上呼吸道等相關症狀，且具新型流行性感冒相關之旅遊史、接觸史、職業史，應儘速至該等醫療機構尋求診治，經醫師評估是否予以採檢及給予流感抗病毒藥劑。
該局亦將與農政單位共同監視國內外動物、人類之疫情，期望能把握先機，作好最佳的準備。