只要經醫師確認沒有接種禁忌症（已知對疫苗成分嚴重過敏或過去接種曾發生嚴重不良反應），就可以接種流感疫苗；接種疫苗後，偶有出現注射部位疼痛、紅腫，或發燒、頭痛、倦怠、皮膚搔癢、紅疹等輕微反應，通常1-2天內會自然恢復，家長只要多協助觀察並配合醫師的建議處置即可。

流感疫苗是預防流感最有效的方法，數十年的使用歷史已證明其安全性，6個月大以上之幼兒，每年均建議接種流感疫苗。

因6個月以下寶寶尚無疫苗使用效益及安全性等臨床資料，依照疫苗產品仿單非適用對象，故未列於計畫實施對象。

6個月以上至國小入學前幼兒，計畫實施期間以「出生年月日」計算月齡滿6個月以上（月齡計算無寬限期，需滿6個月足月，非以出生後180日計算）至國小註冊就學前之幼兒即可接種。

若國小入學前幼兒年紀符合流感疫苗計畫接種對象，且雙親任一方持有我國護照、居留證或具健保身分，或幼兒具健保身分，即符合政府公費疫苗提供對象。

衛生福利部疾病管制署基於防疫考量及維護非本國籍或未具戶籍等收容機構兒童之健康權益，請衛生單位於收到社政、警政、戶政、收容機構或監管單位通知轄區該等個案時，即協同安排各項常規疫苗接種（含流感疫苗），以建立兒童免疫力，保障其與本國籍兒童獲得同等之預防接種保護。108年起衛生福利部為積極掌握該等對象提供必要之醫療照護，其中對於政府部門收容安置或開案輔導中之13歲以下非本國籍兒少，由相關單位造冊通知疾病管制署轉知地方政府衛生局，協助個案完成預防接種。另針對前述以外之無國籍兒童，雖然可接種公費流感疫苗，惟衛生單位無從掌握該等兒童行蹤及疫苗接種狀況，致難適時提供疫苗接種服務。
 

6個月以上接種劑量為0.5mL，需注意各廠牌疫苗適用年齡略有不同。有關季節性流感疫苗接種劑次，經提115年3月11日衛生福利部傳染病防治諮詢會預防接種組(ACIP)會議討論決議，考量未滿3歲兒童初次接種流感疫苗時，完整接種 2 劑可顯著提升保護效益，故依年齡與過去接種史說明如下表。

流感疫苗過去接種史註1/年齡組註2	未曾接種	僅曾接種1劑者	曾接種2劑者
6個月以上至未滿3歲	2劑 (間隔4週以上)	2劑 (間隔4週以上)	1劑
3歲以上至未滿9歲	2劑註3 (間隔4週以上)	1劑	1劑
9歲以上	1劑	1劑	1劑

註1：流感疫苗過去接種史採當年度流感季前累計接種劑數計算，不限於同一個流感季接種。
註2：參依國際間接種建議，依幼兒於當年度流感季接種第1劑時之所屬年齡組及過去接種史，判定當年度流感季應接種劑數。
註3：未滿9歲但已入學者，依據99年3月23日ACIP第1次會議決議，國小學童於學校集中接種流感疫苗，考量接種率、實務執行面等因素，統一提供1劑公費疫苗，故國小一、二年級學童若有第2劑流感疫苗接種需求，可於學校接種第1劑至少隔4週後，至醫療院所自費接種第2劑。

以115年10月1日開打為例，
範例一：
112年4月出生之幼兒，曾於112年11月(滿7個月)接種一劑流感疫苗，115年10月(滿3歲6個月)僅需接種一劑流感疫苗。

範例二：
112年11月出生之幼兒，曾於114年12月(滿2歲1個月)流感季接種一劑流感疫苗，則115年流感季接種情境如下：

1. 若於115年10月(滿2歲11個月)接種115年流感疫苗，因未滿3歲且過往累計僅接種一劑，故應於間隔4週後接種第2劑。
2. 若於115年12月(3歲1個月)接種115年流感疫苗，則無需接種第2劑。

範例三：
109年2月出生之國小一年級學童，出生至今未曾接種過流感疫苗，115年11月於學校接種一劑公費流感疫苗後，可於4週後自行前往醫療院所自費接種第2劑。

各廠牌的疫苗雖然製程略有不同，但所含病毒之抗原性相似，其效果一樣，亦無安全之慮，經提109年7月6日衛生福利部傳染病防治諮詢會預防接種組(ACIP)會議討論決議，需接種2劑之兒童，2劑可接種不同廠牌疫苗。

當年度需接種兩劑流感疫苗者，建議以同一種類（活性減毒或不活化）疫苗完成接種，以獲得最佳保護力。

依據國光公司安定伏裂解型流感疫苗及高端公司福喜健三價流感疫苗之仿單說明，該兩廠牌疫苗適應年齡為3歲以上兒童及成人，故不建議接種於未滿3歲幼兒，另廠商目前並無未滿3歲幼兒接種該疫苗之臨床資料可供解釋或說明其安全性及有效性。如未滿3歲幼兒誤接種該兩廠牌流感疫苗時，由於其疫苗內含抗原劑量與其他流感疫苗一樣，故不必再補接種其他適用疫苗，惟醫療單位均應通知/告知當事人，追蹤個案狀況並向轄區衛生局(所)通報接種異常事件。

公費流感疫苗為單劑型，每劑0.5mL。不論是幼兒還是成人均接種0.5mL劑型，3歲以下幼兒接種劑量無須減半。
如發生接種劑量不足時，應於當日立即補足至個案應接種之劑量，如於隔天或隔天之後補接種，則須補接種完整0.5mL疫苗；如發生接種劑量超出應接種量時，視為完成接種，無須再補接種。
如發生出現接種劑量錯誤時，醫療單位均應通知/告知當事人，並應向轄區衛生局(所)通報接種異常事件。

1.鼻噴式流感疫苗是活性減毒流感疫苗，若於接種前，使用流感抗病毒藥物，可能干擾活性減毒流感疫苗效果，應延遲接種。因藥物特性不同，用藥與疫苗接種最短間隔時間建議如下：oseltamivir 或 zanamivir： 48 小時、peramivir ： 5 天；baloxavir ： 17 天。
2.已接種鼻噴式流感疫苗，於接種後兩週內因感染流感而使用流感抗病毒藥物，可能影響疫苗保護力，應重新接種不活化流感疫苗。

鼻噴式流感疫苗(LAIV)與血液製劑之間無時間間隔限制，LAIV可與血液製劑同時，或於其前後任何時間接種，均視為完成接種。