2001年9月11日，美國發生大規模的恐怖自殺性攻擊事件，在世人震驚之餘，接踵而來的炭疽信件攻擊威脅，短短數週內，發生五例疑似收到含有炭疽粉末信件而遭受感染導致死亡的案例，造成美國人民極大的心理恐慌，同時喚起世界各國對生物恐怖行動的關切。各國亦均體認到應再加強現有的防疫體系，以應付人為蓄意的生物恐怖攻擊行動。
行政院游院長於本（九十三）年十一月十六日特別裁示「反恐行動刻不容緩」，「行政院反恐怖行動管控辦公室」亦已於本年十一月二十二日正式成立，針對暴力、生物、毒化物、放射性物質、重大公共設施、資通及其他等類型的恐怖攻擊，分別設立七個應變組，各單位已派員進駐行政院反恐怖行動管控辦公室作業。
行政院衛生署為強化國家生物防護效能與應變機制，協同國防部共同規劃生物防護訓練課程、籌購訓練裝備，以強化我國生物防護之能量，生恐應變訓練課程除排定針對相關政府機構及公私立醫療單位調訓之學科課程外，並可依需要對一般民眾提供有關反生恐方面之教育，期能全面提昇我國對生恐應變之準備，建制完整緊急應變機制。
衛生署疾病管制局郭旭崧局長與國防部軍醫局陳宏一局長於本年十二月二十八日上午十一時十五分簽訂合作協議，未來將培訓我國專業生物防護部隊，搭配精實之專業設備，於生恐事件發生時得緊急出動、立即針對現場狀況進行因應，並藉由兩單位合作規劃建置完善的準備策略，配合現有之監測系統、防護措施、偵檢作業，在行政院「三、三、一」反恐機制律定下，由軍民共同建構我國反生恐應變網絡。