2010年臺灣南區(雲林縣、嘉義縣市及臺南縣市)共發生8例日本腦炎確定個案, 首例確定個案於5月下旬出現,另7例皆集中於6月發生,與近3年相較,2010年臺灣南區日本腦炎流行情形已超過同期之流行閾值。本篇報告主要分享衛生單位對於2010年日本腦炎確定個案疫情調查與推測疑似感染源之過程與經驗,來作為其他相關單位人員疫調方向之參考,並統計個案感染日本腦炎之可能環境危險因子,結果以水溝與鴿舍為最普遍存在。另建議落實疫情與環境調查、辦理預防接種、衛教宣導與健康監測、進行疾病監測及訪視醫療院所加強通報、及懸掛誘蚊燈之相關防治作為。