為評估我國季節性流感疫苗保護效力,提供流感防疫政策參考,疾病管制署自2011年起於每流感季期間,與病毒性感染症合約實驗室合作,選定門診院所為監測點,以病例對照研究法,計算當季流感疫苗保護效力。2013–2014年流感季評估結果顯示,對於不分型之流感,疫苗保護效力為51%;以病毒型別而言,對於主要流行之H3N2流感保護效力為71%,A型流感整體保護力51%,B型流感保護效力34%,本結果顯示接種流感疫苗具保護效益,惟未達統計顯著差異。2014-2015流感流行季仍建議民眾接種流感疫苗以有效預防流感。