一、監測目的
腦炎症狀由於不具特異性，加上病程發展快速，且可能產生神經後遺症，已成為臨床診斷及治療上一大難題，因此監測發生腦炎症狀的病人，運用Multiplex RT-qPCR檢測，檢驗結果可及時輔助醫師診斷及治療，亦可瞭解國內特有腦炎之流行型態，更重要的是可監測透過腦炎症狀現蹤之新興/新型傳染病。

二、送驗條件
住院病患同時合併以下三項條件： 
 (一) 急性發作； 
 (二) 出現未明原因之腦病變症狀，如意識狀態改變、嗜睡、人格改變等超過24小時； 
 (三) 出現以下任一症狀或情形: 發燒超過38度、抽搐(seizures)、局部神經症狀(focal neurologic findings)、腦脊髓液任何一項檢驗為異常 、腦波(EEG)檢查異常 、腦部影像(CT or MRI)異常。 

三、​​​​​送驗檢體種類
 (一) 腦脊髓液 (必要檢體) 0.5mL以上、病毒咽喉拭子及血清。
 (二) B類感染性物質包裝，2-8°C運送。