疾病管制局於今年四月份起於宜蘭縣、苗栗縣、南投縣、台南縣、屏東縣及花蓮縣等六個縣市之肉品市場辦理「豬隻日本腦炎抗體監測計畫」，以掌握病毒在自然界的散佈情形，及時提醒民眾防範。依監測資料，豬隻日本腦炎抗體陽性率先後於四月份(苗栗縣)、五月份(屏東縣、台南縣、宜蘭縣及花蓮縣)、六月份(南投縣)超過50%。台灣地區仍以豬隻為日本腦炎病毒主要增幅動物，日本腦炎病毒在豬隻增幅後，開始人的流行。
今年截至目前為止，累計通報病例為93例，其中有6例確定病例，均為成年人，年齡為32-65歲，其中5例不屬日本腦炎疫苗接種世代，個案未接種過日本腦炎疫苗。個案居住地分別為台南縣2例，桃園縣、彰化縣、屏東縣及嘉義縣各1例。
根據歷年流行病學資料，日本腦炎主要流行季節為5-10月，病例高峰通常出現在6-7月。感染日本腦炎，會產生頭痛、發燒或無菌性腦膜炎等症狀，嚴重者可能導致精神、神經性後遺症或死亡。
疾病管制局呼籲民眾，避免於黃昏後(病媒蚊活動的高峰期)，在豬舍、其他動物畜舍或病媒蚊孳生地點附近活動。若無法避免，請穿著長袖長褲、身體裸露處塗抹防蚊藥劑，避免蚊蟲叮咬，以降低感染風險。尚未完成日本腦炎疫苗接種之適齡幼兒，父母親應儘速帶領幼兒前往衛生所或指定醫療機構完成接種；工作或生活中有感染之虞且有意願接種的成人可前往全國26家署立醫院或分院自費接種。