印尼2025年報告706,000例病例，為該國近年來最高，主要分布於東部地區，尤其巴布亞省，人口流動造成疾病由流行地區傳播至其他地區，如2024年廖内省部分地區再度發生疫情，導致2026年初當地多次宣布進入疫情緊急狀態，此外，氣候變遷及資金缺乏亦為影響疫情上升的因素。該國於2023及2024年分別報告418,000及543,000例病例。

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