福氏內格里阿米巴原蟲感染是一種罕見的疾病，避免吸入受污染的水能預防感染。民眾於進行水上活動或泡溫泉等活動時，可以使用鼻夾避免水進入鼻腔，或避免將頭部浸泡於水中。浴室業、游泳業等營業場所應落實執行營業衛生管理事項，包括水池衛生管理、自由有效餘氯符合1-3 ppm等，並完備相關自主衛生管理措施。此外，民眾應避免在炎熱、水溫高或低水位時於戶外戲水，並避免攪動底部池水或淤泥。

該疾病於1965年在澳洲發現首例人類感染病例，主要發生於夏季。截至2023年統計資料顯示，全球確定個案約488例，美國每年少於10例患者，臺灣於2011年及2023年各有1例確定個案。

人類經由鼻子吸入含有福氏內格里阿米巴原蟲的水而受到感染。將鼻子或頭部浸入受污染的水中（如游泳、潛水、跳水等與水有關的活動），可能造成感染，男孩風險可能增加(與喜好玩水活動或許有關，但真正原因不明)。但喝到含有福氏內格里阿米巴原蟲的水不會被感染。福氏內格里阿米巴腦膜腦炎不會人傳人。

內格里阿米巴(Naegleria)為環境中自由營生的單細胞阿米巴原蟲，有40餘種，其中只有福氏內格里阿米巴原蟲(Naegleria fowleri)會感染人類。福氏內格里阿米巴原蟲為淡水湖泊、河流中自然生存的單細胞原蟲，喜好溫暖環境，能生存於46℃的溫熱環境中，在更高的溫度下也可短暫存活。溫暖的淡水(如湖泊及河川)、溫泉水、工廠排出的溫水、含氯量不足的游泳池、熱水器及土壤中都可發現其蹤跡，人工水域維持水中自由有效餘氯在1 ppm以上，即可有效抑制。

人類經由鼻子吸入含有福氏內格里阿米巴原蟲(Naegleria fowleri )的水而受到感染。蟲體由鼻腔進入人體後，經由嗅覺神經進入大腦引發福氏內格里阿米巴腦膜腦炎。

潛伏期1～7天，平均為5天。

一開始的症狀可能包含發燒、頭痛、噁心或嘔吐，之後出現頸部僵硬、意識改變、喪失平衡感、抽搐及出現幻覺，病程進展快速，從出現症狀到死亡約5天，致死率超過97%。

實驗室診斷可採集腦脊髓液，並以疾病管制署已經建立的分子生物學技術(PCR)，進行病原體檢測。

藥物用於治療人類感染的效益尚不明確。