病原微生物基因體資料庫分析平台於防疫之應用

黃元品、姚清源、陳昱汝、莊博丞、許麗卿、吳和生

2010年 第26卷 第21期

通訊作者: 黃元品

  • 衛生署疾病管制局研究檢驗中心

摘要:


病原微生物基因體資料庫分析平台(http://tpmgd.cdc.gov.tw/tpmgd_public/)完善整合病毒基因序列及其相對應流行病學資料,是全國唯一具完整性及多樣性的病原體基因資料庫。透過病原體資料分析,除可監測基因序列變異,提供極具價值的分子流行病學資訊供防疫參考外,也是發展致病原檢驗技術與評估疫苗成效的有力工具。資料庫目前內含腸病毒、流感病毒及腺病毒重要基因序列與基本流病資料達1萬1千多筆,疾病管制局除定期上傳自行產出之病原體相關資訊外,亦主動更新匯入美國國家生物技術信息中心 (NCBI) 及世界衛生組織 (WHO) 釋出之病毒序列資料,與國際訊息即時接軌。網站建置迄今成效諸如建立起台灣本土流感病毒流行預測模式、98年新型流感H1N1之抗原性及抗藥性監測、迅速比對腸病毒71型流行基因亞型,及於97年年初針對腸病毒大流行提出預警等。目前網站各種資料分享及查詢分析服務均為無償提供一般大眾使用,本局研究檢驗中心期許藉由這些病原體相關資料的分享,可帶動國內醫藥相關衛生技術產業之研究產出,並增進與國際間病原體訊息之合作交流。