應用WGS-PCR方法輔助痢疾桿菌鑑定之探討

魏孝倫^*、廖盈淑、鄧如琇、陳柏翰、邱乾順

2023年 第39卷 第2期

通訊作者： 魏孝倫^*

摘要：

        志賀氏桿菌會引起桿菌性痢疾，目前列為我國之第二類法定傳染病，此病原近五年每年平均造成104例的本土個案。由於志賀氏桿菌鑑定標準方法係以傳統生化試驗配合血清學分型，但此法仍無法明確鑑定部份的志賀氏桿菌，造成臨床醫學實驗室通報的困擾。為提升志賀桿菌的鑑別度，本研究以臨床分離株測試以基因體為基礎的PCR分型法(WGS-PCR)，此法主要測定志賀氏桿菌基因體的各個演化枝，並搭配志賀氏菌及腸侵襲性大腸桿菌(enteroinvasive E. coli, EIEC)專一性基因IpaH的測定，來鑑定出志賀氏菌的血清群。我們以30株痢疾桿菌確認菌株進行驗證，發現WGS-PCR在血清群B、C、D的結果與血清凝集法有100%的一致性，但在血清群A的結果與血清凝集法僅有20%一致。另外以WGS-PCR測試29株疑似痢疾桿菌菌株，各有2株菌株被鑑定為血清群B及D，亦顯示WGS-PCR可用於鑑定血清群B及D菌株，可明確釐清疑似菌株。WGS-PCR只需進行低成本的PCR檢驗，我們建議可作為血清凝集法的輔助試驗，以提升志賀氏菌的鑑別度。

關鍵字：志賀氏桿菌、WGS、PCR

高防護實驗室負壓自動控制系統更新及異常事件檢討—以疾病管制署臺南生物安全第三等級實驗室為例

黃仲德、劉健良、林建州^*

2023年 第39卷 第2期

通訊作者： 林建州^*

摘要：

        高防護（BSL-3/ABSL-3以上）實驗室在2020年嚴重特殊性傳染性肺炎(COVID-19)疫情爆發後，益顯得防疫的需要和生物安全的重要性。以疾病管制署臺南BSL-3實驗室之負壓自動控制系統更新案為例，說明高防護實驗室之功能運作和意外事件處置，分享實驗室生物安全實務經驗，提供國內建置高防護實驗室之單位參考。(一)自動系統依客製程式監控各機組，進氣及排氣機組以主/備用輪替使用，生物安全櫃(Bio-Safety Cabinet, BSC)排氣和室內環境排氣連動，設定「無人進入」（降載）、「人員進入」、「人員進入及使用BSC」等三種模式，依現況調節負壓值以節省能源。以動態圖式監控各機組運作情況，異常狀況發生時可透過網路通知管理人員；(二)實驗室發生負壓異常或喪失，且無法立即恢復時，依法須於24小時通報各級主管機關。實驗室人員可藉由登入疾病管制署「實驗室生物安全管理資訊系統」進行異常事件通報，再依循該署「高防護實驗室啟用、暫停及關閉規定」，辦理暫停使用以及後續恢復使用程序。在面對國際間高傳染性疾病不斷發生，各單位意識到疫病檢驗和疫苗研發所需高防護實驗室之必要性，故紛紛投入資源建置。對維持高防護實驗室之正常運作以及發生異常事件之處置，皆需熟悉相關法規及安全防護，以避免發生生物危害意外。

關鍵字：高防護實驗室、負壓自動控制系統、負壓異常、異常事件通報

2022年第52週–2023年第1週 (2022/12/25–2023/1/7)

衛生福利部疾病管制署疫情中心

2023年 第39卷 第2期

摘要：

        全球COVID-19疫情持續處此波疫情高峰，惟病例數可能低估；中國疫情仍嚴峻，流行株仍以BA.5.2與BF.7為主，另已發現特定位點突變之BA.5.2.48與BF.7.14變異株，各地已開始湧現春運人潮，需持續關注對我國疫情影響；BA.5及其衍生變異株仍為全球主流株，BQ.1、BA.2.75及XBB等變異株佔比續升，將持續監測國際間病毒株之演變與流行。
        國內COVID-19新增本土病例數、中重症數及死亡數上升，另COVID-19境外移入病例數快速上升且進入春節前返國高峰期，變異株進入社區風險可能增加，呼籲持續加強長者等重症高風險族群疫苗接種與及早用藥，並落實個人防護措施，持續密切監測國內變異株及疫情變化。