中國大陸9月共通報法定傳染病546,932，死亡1,390人。甲類傳染病報告鼠疫1例（死亡）及霍亂7例。乙類傳染病共通報317,564例，死亡1,353人，發病數居前5位的疾病為病毒性肝炎、肺結核、梅毒、細菌性和阿米巴性痢疾、淋病，佔乙類病例總數的96%。丙類傳染病通報229,360例，死亡36人，發病數居前3位的疾病為手足口病、其他感染性腹瀉病和流行性腮腺炎，佔丙類病例總數的95%。
其中明顯高於去年同期的疾病有：

1. 百日咳報告216例，較去年同期（150例）增加44%。
2. 猩紅熱報告2,813例，超過去年同期（1,169例）2.4倍。
3. 流行性腮腺炎報告20,454例，較去年同期（15,225例）增加34%。