非洲撒哈拉以南的流行性腦脊髓膜炎帶西起塞內加爾，東至衣索比亞，年發生率高達1000例/每10萬人口，近6年（2003-2009）導致近27萬人感染，2萬5千人死亡。流行性腦脊髓膜炎帶的21國中，已有14國加強監測（貝南、布吉納法索、喀麥隆、中非、查德、象牙海岸、剛果民主共和國、衣索比亞、幾內亞、迦納、馬利、尼日、奈及利亞、多哥），該14國2009年1-22週流行季共通報78,416例流行性腦脊髓膜炎，含4,055例死亡，病例數為1996年以來最高紀錄，原因是奈及利亞疫情擴大。奈及利亞2009年1-22週流行季共通報55,626例，含2,307例死亡，占14國的70%以上，而尼日疫情居次（通報12,604例，含510例死亡），查德則疫情減小且集中於首都N’Djamena市（通報1,299例，含140例死亡），尼日與奈及利亞致死率均低，約為4%，但查德致死率為10.8%。
布吉納法索今年截至2/7已通報2,298例流行性腦脊髓膜炎，致死率13%，病例數最高。多哥今年通報108例，25例死亡，致死率23%最高。查德截至2/19通報507例，56例死亡，致死率11%。迦納Upper West地區今年已17人死於流行性腦脊髓膜炎，通報的96例中15例確診。