納莉颱風重創台灣地區，風災水患過後，相關防疫人員早已展開緊鑼密鼓的衛生消毒工作，並嚴密監控傳染病之疫情。衛生署疾病管制局表示：由於鄰近的東南亞國家，常於洪水氾濫後爆發鉤端螺旋體病之流行（如泰國，曾於2000年7-8月間，於水災過後爆發鉤端螺旋體病之流行，約5000餘人感染，近200人死亡）。因鉤端螺旋體菌可感染所有的哺乳類動物（包括人類在內），如牛、豬、馬、狗、鼠類等，造成腎臟慢性感染，並由尿液大量排菌於環境中；而國內部分淹水地區之環境，如受到帶菌動物之尿液污染，該菌可能存在於污水及潮濕的土壤中，當人接觸到被污染之污水或濕土時，可經由皮膚傷口感染此病。因此，疾病管制局除特別提醒民眾預防該疫病之傳染外，亦將鉤端螺旋體病列入災後重點監測之疾病，惟自納莉颱風過後，淹水地區目前尚未發現有任何確定病例出現。

鉤端螺旋體病係一種常見之人畜共通傳染的細菌性疾病，經由口、皮膚等直接觸病原菌而受感染，可引起人及多數哺乳類動物發燒、黃疸、血尿、肝、腎衰竭等症狀。其傳染途徑：

1. 可經食入受病原動物之尿液污染的水或食物而感染。
2. 當人們工作或活動時，如有病原菌存在環境中（如淹水地區之污水），可經由皮膚傷口進入人體而感染，另外，也有可能由口腔黏膜、眼結膜、鼻腔或生殖道的傷口侵入。該病之潛伏期為4-19天，通常為10天；其臨床表徵不一，可從類似感冒之輕微型（約90%受感染者）到嚴重致命之黃疸型（約5-10%受感染者）不等，典型之症狀包括高燒、嚴重頭痛、畏寒、肌肉痠痛及嘔吐，另外還可能出現黃疸、結膜充血、腹痛；部分嚴重型患者若未接受及時診斷及治療，會進展到腎衰竭、肝衰竭等病變。此病如經早期診斷並投予有效之抗生素，通常可完全治癒，但本身有肝、腎等慢性疾病且未經適當治療者之死亡率可能達20﹪。

衛生署疾病管制局特別提出以下幾點預防方法，並呼籲民眾加強防範：

1. 進行環境、器具之清潔請先施行消毒，涉水時應著防護膠鞋，鞋，避免接觸污染水質；工作完畢後，即刻以肥皂充分洗淨。
2. 避免在不明水源及不流通的野外水池中赤足涉水。
3. 暴露於污水或潮濕土壤中時，應著長靴及戴手套等保護措施。
4. 接觸動物後立即洗手。

衛生署疾病管制局同時呼籲，醫師如在臨床上如有發現病患曾有動物接觸、野外活動或暴露於被感染動物尿液污染之環境（如污水、溼土等），並出現急性發燒、頭痛、肌肉痛（尤其常見小腿肚痛）之病例，應加強向衛生單位通報，並儘速採集檢體送至本局合約實驗室檢驗，及早給予病患適當治療，防範疫情之擴大蔓延。