疾病管制局分析合約實驗室自2004年9月1日至2005年2月17日止，共計收受呼吸道檢驗3,790人之資料，扣除尚在檢驗中者計有3,452人，結果為病毒陰性者有2,375人，約佔68% ； 而流感病毒陽性者453人，約佔13.1% ，其中二歲以下嬰幼兒佔7%，而65歲以上者約佔2%；其它病毒例如：腺病毒、腸病毒、RSV、CMV等約佔19%左右。
2004年9月起針對6月~2歲者約383,566人實施流感疫苗接種，至今使用率已達97.4%，剩餘量約1萬多劑。為瞭解幼兒接種效果，再針對上述資料合乎接種對象6月~2歲者754人，扣除正檢驗中未有結果56人，其餘698人之檢驗結果及流感疫苗接種情形進行分析。流感病毒陽性者計28人，其中未接種者20人，有接種者8人；另流感病毒陰性者計670人，其中未接種者339人，有接種者331人；分析發現其危險對比值OR為2.44，95%信賴區間為1.011~6.492已達統計顯著意義，初步推論未接種流感疫苗者得到流感病毒感染之危險性為有接種者之2.44倍。
另根據疾病管制局定點醫師類流感監測資料顯示，今年的第6週（94年1月30日至2月5日）平均每位定點醫師通報的類流感病例人次數33.8例，與前一週之34.9例相差不多，亦較去年同期的26.6例為高，至今仍屬高峰而且近幾週氣溫亦趨於低溫，近日寒流又將來襲，流感病毒將更容易增殖活躍，更容易造成傳染與流行。該局表示，流感疫苗有接種絕對比沒接種好，因為接種後可以預防感染或減輕症狀；早接種亦比晚接種好，只要有接種就不嫌晚，目前政府採購的疫苗，各縣市均存量不多，籲請符於接種條件的民眾儘速至轄區的衛生所或合約醫院診所洽詢，瞭解接種地點，就近完成注射。