流感疫苗保護力是指接種流感疫苗的人群與沒有接種疫苗的人群相比，減少了多少罹患流感、重症或死亡的風險。流感病毒變異迅速，每流感季使用之疫苗株均不同，對疾病之保護力亦受當年流行株與疫苗株吻合度影響，故每年評估疫苗保護力有其必要性，除用於公眾溝通外，亦能作為政策成本效益評估的重要參考，世界各國亦多有常規評估流感疫苗保護力之監測網路。
       為評估我國公費流感疫苗之保護力，本署與中央研究院統計科學研究所合作，自112 年流感季起串聯「全國性預防接種資訊管理系統(NIIS)」、「傳染病通報系統(NIDRS)」與「全民健保資料庫」資料，利用回溯性世代研究評估公費流感疫苗對各類對象之疫苗保護力，歷年評估結果如下表。目前正進行114年流感季流感疫苗對6個月至未滿6歲幼兒之保護力評估。

歷年結果

		疫苗對實驗室確診流感之保護力估計(%)
流感季	對象	門診	住院	重症	死亡
2023-2024	65歲以上長者	29.6	33.2	75.2	67.8
2024-2025	65歲以上長者	44.8	58.2	70.0	71.9

參考論文

1. Yi-Ting Huang, Tsung-Pei Tsou, Szu-Han Kuo, Yen-Tsung Huang, Assessment of influenza vaccine effectiveness among the elderly in Taiwan using population-based registry data for the 2023–2024 season. Vaccine, Volume 64(3),2025. https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2025.127690
2. Tsung-Pei Tsou, Yi-Ting Huang, Chieh-Yu Lin, Po-Wei Chu, Yen-Tsung Huang. Influenza Vaccine Effectiveness Against Influenza-Related Medical Visits, Hospitalization and Death Among Adults aged 65 Years and Older in Taiwan: 2024-2025 Season (preprint, under review). DOI:10.2139/ssrn.6982164