H1N1新流感疫情於4/24爆發後，疾病管制局立即透過GISAID網站取得新流感病毒之基因序列，並進行基因序列比對及分析，請百力公司設計合成反轉錄聚合酶連鎖反應（real-time RT-PCR）與傳統RT-PCR 檢驗試劑之引子（primers） 與探針（probes）。4/28向動物科學研究所及農委會動植物防疫檢疫局取得豬流感病毒之RNA作為陽性對照組，並於當天日完成敏感度與專一性測試，經測試比對無誤，證明該局己具確認檢驗之能力，而這該項檢驗方法立即上線進行相關檢體之檢驗。
針對外界誤傳中國大陸先於台灣研發新流感病毒快速檢驗乙事，經疾管局郭局長與中國疾病預防控制中心王宇主任聯繫後表示，中國大陸並未如此宣稱，並強調該項報導是呈現多國合作研究結果，而中國大陸目前所採用之檢驗方式和我國大同小異。