有鑑於目前侵襲亞洲的H5N1禽流感病毒可能引發新型流行性感冒大流行，衛生署疾病管制局於7月7日假國家衛生指揮中心辦理「新型流行性感冒兵棋推演」。行政院已於今年5月通過「我國因應流感大流行準備計畫」，針對各項防治工作流程，衛生署疾病管制局另編訂有「流感大流行防治作戰動員及準備計畫」。為熟練既有標準作業流程、部門間協調合作，該局將軍事上的兵棋推演概念應用至防疫動員，針對新型流行性感冒的疫情演進辦理推演。
本次推演設定的情節為國外禽流感病毒已演變為可人傳人，國人在國外感染後將病毒帶入國內。參與的單位包括行政院及相關部會、衛生署及所屬單位、部分縣市政府、感染症防治醫院及病毒合約實驗室等，分別依設定情節，就大流行等級進入A1級與A2級之組織運作、來自感染區入境旅客後送採檢、疫情調查、疑似病例後送就醫等工作進行演練。
世界衛生組織(WHO)於6月28日公布之A(H5N1)禽流感病毒感染人數，已累計108例，其中54例死亡。WHO並於6月30日發表對越南疫情之評估報告，仍然維持2004年1月起對禽流感恐引發全球大流行的警戒。此外，中國大陸的新疆及青海近日已證實高病原性禽流感疫情，亦不能排除此疫情有後續發展的可能性。因此衛生及相關政府部門對於流感大流行的威脅不敢掉以輕心，均期待藉由本次兵棋推演，預先發現問題並提出解決方案。
為有效進行疾病監視，並儘早治療病例，衛生署已於93年12月29日公告「新型流行性感冒」為法定傳染病，截至94年7月6日，共接獲31名符合新型流行性感冒採檢條件病例之通報，均經檢驗排除。除此之外，抗病毒藥劑將是最重要防治手段之一，「我國因應流感大流行準備計畫」將其儲備列為重要工作，但目前95年度經費尚無著落，實為一大隱憂，因先進國家也紛紛積極進行儲備，需求量相當大，製造廠必須依據各國確認之採購量，依提出順序納入製造排程，疾病管制局目前僅能盡最大努力爭取財源，以免我國需求量於製造排程中取消，而導致2003年SARS造成的健康危機與社會衝擊重演。