新興及再浮現傳染病於全球化之威脅下，單一國家的傳染病疫情，就可能於短時間內蔓延國際。為防堵國際疫情擴散，防範疫病入侵國內，衛生署疾管局整合流病調查、實驗室、病媒防治及防疫醫師等專業人員60餘位，組成「境外防疫大隊」，並承諾願意在第一時間進入疫區，與國際防疫人員攜手合作，以「決戰境外」為目標，協助阻絕疫情蔓延。
爲實踐全球防疫體系觀念，世界衛生組織（WHO）全球疫情警報與反應網絡（GOARN）派遣400名各領域專家，遍及全球40餘國，協助處理各類疫情；美國CDC（疾病控制及預防中心）除隨時機動從亞特蘭大總部派員逕赴國外疫區外，另有 200位專家人員，長駐全球40餘國，協助疫情防治事宜。
另，美國CDC專家Dr. Michael Malison，亦於1984年獲邀來台四年，協助我國推動「應用流行病學專業人才訓練及養成計畫」，成為我國流行病學專業人員訓練之濫觴。1982、1998及2003年台灣發生小兒麻痺流行、腸病毒疫情及SARS風暴時，美國CDC均於第一時間選派專家提供適當的支援，對我國的防疫工作有長遠的貢獻。
疾管局「境外防疫大隊」歷經兩年多的籌備，已於民國96年6月27日正式成軍，此乃我國防疫工作國際化的重要里程碑。該隊自2005年起就已曾派員協助泰國南亞海嘯救災、2007年支援肯亞裂谷熱疫情及支援巴拉圭登革熱防治工作，累積境外防治之實戰經驗，進而貫徹防疫決戰境外之理念。
該大隊配有現代化通訊設備、重要防疫物資、機動化行動實驗室，可迅速掌握國際重要疫情資訊，於第一時間組派隊員參與國際防疫任務，確實遵守行動任務紀律規範，並以精良的配備及高昂的鬥志，協助友邦戰勝傳染病的威脅。
疾病無國界，在人類互動交流頻繁的今日，全球防疫體系面臨險峻的挑戰，使得遠在地球彼端的傳染病極有可能一日內兵臨國門，入侵社區、鄰里及家庭。「境外防疫大隊」除能以專業防疫知能，回饋國際社會外，亦有效提升台灣整體防疫量能，增加我對於新興及再興傳染疾病的整備，進而減少疾病對於國人健康的威脅，落實「防疫災於未然，阻疫情於境外」之防疫策略。