有關媒體報導「健保局”清床”措施恐造成防疫漏洞 」，衛生署提出澄清。
一、為落實「結核病十年減半全民動員計畫」，鼓勵醫療院所收治痰塗片陽性之開放性肺結核個案，自96年起將該病患住院醫療費用，優先由公務預算支應，且在合理申報範圍內皆不於核刪，另僅由胸部X光片診斷之肺結核，則由健保局「健保總額支付制度」支付，全面確保結核病就醫品質（配合疫情防治需要，自95年起即由健保局轉知健保審查委員配合辦理），針對特殊個案亦提供妥適之照顧，保障國人健康。
二、本署疾病管制局及健保局合作，自93年1月1日起即實施「全民健康保險結核病醫療給付改善方案試辦計畫」，目前約有250家醫療院所加入本計畫，照顧病患數已達7成以上所有結核病患，其主要目的如下：
（1）改善支付方式，鼓勵醫療提供者確實擔負個案管理照護及衛教之責任。
（2）完成結核病患之診療，確保提昇醫療品質。
（3）醫院設置個案管理師，建立公衛、醫療網絡平台，降低結核病病患就醫失落率、提高結核病個案完治率。
三、衛生署除在醫院透過個案管理給付方式，逐步達成降低結核病病患失落率，以避免傳染源流動及抗藥性結核病菌的出現。結核病患服藥2週，傳染性即大大減低，完整的療程至少6個月以上，痰檢查陽性轉為陰性才不具傳染性，尤其是痰陽病患在醫院即接受「送藥到手、服藥到口、吃完再走」的「都治策略」，將有效增強病患服藥順從性，出院後更由社區都治關懷員持續介入監督服藥及關懷支持，期以醫療及公共衛生體系緊密聯手合作，全力配合政府結核病防疫政策，有效杜絕結核病發生，間接降低醫療及社會成本。