人芽囊原蟲(Blastocystis hominis)是一種常見腸內寄生蟲，其分布是全球性的，主要分布於(亞)熱帶及開發中國家。對於人芽囊原蟲的生物學及其與其他生物的關係，至今仍不是很清楚，目前臺灣常見的案例為外籍勞工健康檢查時發現。

傳播方式：

人芽囊原蟲感染途徑仍不是很清楚，似乎與環境衛生或個人衛生不佳有關。研究發現可能的感染風險，包括：食用受污染的食物或飲水、暴露於安養院環境或與動物接觸。

潛伏期：

人芽囊原蟲可存在腸內數週、數月或數年。

發病症狀：

感染人芽囊原蟲的人，曾出現的症狀，包括：腹瀉、腹痛、肛門癢、體重減輕、便秘、脹氣等。但許多人感染人芽囊原蟲，並無症狀。人芽囊原蟲可在健康者及病人身上發現。專家對於人芽囊原蟲的致病性，仍有爭論。某些型別的人芽囊原蟲可能較容易與症狀有關聯性。在糞便中發現人芽囊原蟲，仍須進行後續追蹤，尋找其他可能導致症狀的原因。

預防方法：

1. 在如廁後、換尿布及調理食物前，以肥皂及清水洗手。
2. 教導兒童洗手的重要性。
3. 避免食物或飲水遭受污染。
4. 生鮮蔬果須經清洗及剝皮，才可食用。
5. 至國外旅遊，若當地飲水供應不安全，避免飲用未煮沸的自來水或未經煮熟的食物。瓶裝水、罐裝碳酸飲料、殺菌的果汁、熱茶及熱咖啡，則可安全飲用。

治療方法與就醫資訊：

1. 如欲知道自己是否感染人芽囊原蟲，請至醫院進行糞便檢查。
2. 處方藥物可以治療人芽囊原蟲感染。然而，有些治療效果不佳，仍需尋找其他可能導致症狀的原因。
3. 若人芽囊原蟲感染者保持良好個人衛生習慣，傳染給他人的風險低。良好的個人衛生習慣，包括：如廁後及調理食物前，徹底地使用肥皂及清水洗手。

預防接種建議：

人芽囊原蟲目前尚無有效可施打之疫苗。